该寺的建立源自于心道法师创立的佛教宗派——法幢宗。

　　心道法师，湖北荆州松滋县人，俗姓李，生于1905年，圆寂于1968年。他18岁时剃度出家，取法名源福，号心道，同年从钦命净月老和尚受戒于江陵章华寺。此后，先后在江苏镇江金山寺、常州天宁寺、上海兴慈寺、宁波观宗寺研习佛法。

       1930年，他毕业于闽南佛学院，1934年后两度赴青海学习密宗，在塔尔寺从九世班禅大师受时轮金刚大灌顶，又从恩久活佛受密宗比丘大戒和菩萨千佛大戒。1941年9月15日，他在西安大兴善寺传戒时由恩久活佛授记为丹巴增贝堪布佛。次年9月，他赴河西讲经，应张掖古佛寺住持盛请，任该寺方丈，改寺名为大法幢寺，即在此寺建立了法幢宗。

　　那么，心道法师创立法幢宗的缘由又是什么呢？原来，1934年至1936年，心道法师曾受净月老和尚与韩大载居士等的资助，赴青海学习密宗。法音外传，全青海居士纷纷请法师出寺讲经弘法，先后成立多个佛教组织，产生了很大影响。1937年，心道法师在湖北请净月老和尚命寺名，老和尚为表彰他弘法西北，到处破邪显正，深合“建法幢于处处，破邪网于重重”之旨，对他说：“法幢者，即汝之别名耳。”即命名为法幢。没想到，这年秋天，法师第二次到青海，入塔尔寺从西藏恩久活佛受密宗喇嘛戒时，恩久活佛也为他命名法幢。两位师父心念默契、不谋而合，都是希望法师高建法幢，宣扬圣教，渡众生出苦海，转邪外归正道，这正是因缘所在。心道法师鉴于当时西北各地外道猖獗、正法不兴、僧侣无多、佛法衰微的现实，遂创建法幢宗。

　　关于法幢宗立宗修持的宗旨，有24个字的赞偈：“法幢正宗，圆顿法门，禅净双修，显密并宏，破邪显正，是其宗风。”　　

       法幢正宗创立后，心道法师及其门徒在西北各地大行法化、破邪显正，奠定了在西北弘法的坚实基础，为西北佛教的复兴和发展做出了巨大贡献。

       法幢宗建寺多以“法幢”为名，剃度、皈依弟子均以净月老和尚所派偈88字为法幢正宗之演派：

      “心融谛理，道振大千，法演三乘，师资一贯，止观双照，显密通圆，开示了义，体离言诠，信解清净，善超圣贤，彻悟实际，证入幽玄，海印发光，妙音普宣，六度齐修，福智庄严，应机设教，殊胜因缘，和敬温良，礼让益谦，戒定慧学，永远流传。”

       心道法师为法幢宗鼻祖，已故的酒泉融照法师、兰州融开法师等为第二代嫡传弟子。融照法师俗姓殷，名建亳，安西三道沟人。1943年在兰州大法幢寺受具足戒，颇得心道法师赏识，几年后得法脉于心道法师，为法幢正宗二世。酒泉法幢寺现在的住持理顺法师等为第四代嫡传弟子。

　　酒泉法幢寺始建于1945年秋。当时，心道法师在酒泉钟楼寺(原址在今酒泉中学)开炉传戒，改钟楼寺为法幢寺。1984年，法幢寺在酒泉城西北西大桥北侧重新建立，融照法师受请为住持。1995年以后开始迁建现址，1999年9月20日，举行了寺院落成暨佛像开光法会。

      “法幢”有两个义项：一、写有佛教经文的长筒形绸伞或刻有佛教经文、佛像等的石柱；二、比喻佛法。“幢”字有四个义项：一、作为仪仗用的一种旗帜；二、刻着佛号(佛的名字)或经咒的石柱；三、车帘；四、房屋的量名，如：一幢楼房。“幢”字有两个读音：用作前两个义项时读“chu�ng”(音“床”)，后两个义项读“zhu�ng”(音“壮”)。显然，“法幢寺”之“幢”应读为“chu�ng”。但长期以来，人们受“一幢楼房”之“幢”读音的影响，往往错读为“zhu�ng”。在西北各省，以“法幢寺”为名的寺院很多，为方便对外交流，应该注意遵从规范读音。